以現代日本為背景，描繪忍者與極道之間激烈對抗的動作漫畫。1657 年，在明歷大火的背后，由幕后江戶守護者神賽慘蔵與始祖極道、江戶第一任俠幡隨院長兵衛的死斗引發的忍者與極道的宿怨，至今仍在延續。極道，既是那些被社會孤立之人的唯一歸宿，同時也因犯下諸多惡行而屢遭企圖消滅極道的忍者襲擊。竹本組的“幕后組長”兼“破壞之八極道”成員之一輝村極道，為了徹底消滅忍者，使用了一種能異常強化身體能力的毒品——“地獄回數券”，并在東京各處制造引人注目的騷亂，以此引誘察覺惡行而來的忍者。在這場騷亂中，一個不受法律與權力束縛、致力于阻止極道惡行的忍者團體“帝都八忍”中的一員被殺，包括“多仲忍者”在內的同伴們燃起了對極道的復仇之火。另一方面，表面上過著高中生生活的少年“忍者（忍葉）”和表面上作為精英上班族生活的青年“極道（極美）”，因女童向動畫《公主系列》的話題而意氣相投，在彼此不知對方真實身份是“忍者與極道”的情況下建立了友誼。