小智（松本莉香 配音）來自真新鎮，他的目標是要成為神奇寶貝頂級訓練師。在即將展開訓練師旅程的一天，因為遲到，他并沒有拿到初始的小精靈。大木博士（石冢運昇 配音）見狀，便送了一只不愿進精靈球和非常調皮的皮卡丘給這位失落的年輕人。于是，他們倆便踏上了精靈寶可夢的旅程。